海豹突击队六人小组执行抓捕大毒枭卡林多的任务，一切进行得非常顺利。但队员们不知道弗莱克是内奸。他已经向卡林多通报了这次行动，海豹突击队遭到伏击，两名成员丧生。虽然海豹突击队队员人在卧底威利的帮助下抓住了卡林多，但根弗尔逃脱了。海豹突击队船长迈克决定回到卡琳多的豪宅，去抓捕弗雷德为死去的兄弟报仇，并带回他们的尸体，但遭到了老板鲍尔斯的反对，迈克也因此离开了海豹突击队队员。然而，李玮支持他，因为她必须取回珍贵的宝石，这是她在卡林多卧底一年多的目的。在麦克和李玮的劝说下，麦克的老战友罗毅也同意加入战斗。就在迈克夫妇决定前往卡林多的豪宅时，弗拉克尔劫持了国家体操队的成员，并向政府提出用卡林多作为交换条件。为了拯救体操运动员，政府决定释放卡林多。想到死去的两名队友，鲍尔斯决定支持迈克的行动，不让卡林多和弗雷克得逞。在墨西哥湾的魔鬼岛城堡交换人质，这里地势险要。无论从空中还是海上潜入，都会被敌人发现。到达那里的唯一方法是潜水。但是魔鬼岛被鲨鱼包围了，要在这里通过并不容易。鲍尔斯负责护送卡林多到指定地点交换人质。他说服其他几个玩家与迈克合作，对魔鬼岛进行突然袭击。经过一番周折，迈克和他的团队终于到达了魔鬼岛。魏和罗毅负责营救人质，而迈克则与已经到达岛上交换人质的鲍尔斯一起给了弗莱克致命一击。此刻人质被关在地牢里，大量海水注入其中，人质即将窒息。罗毅用他最拿手的爆破技术炸掉了监狱的门，救出了人质。迈克鲍尔斯和迈克鲍尔斯基本上控制了城堡的外部。眼看大势已去，fraker和Calindo挟持了一名人质，登上了一架水上飞机。迈克绝望中乘快艇追上他，迫使飞机无法起飞。经过与弗雷克的激战，迈克终于击败了弗雷克。弗莱克得到了应有的惩罚。他掉进了海里，成了鲨鱼的美餐。人质被成功解救，卡琳多被绳之以法，海豹突击队的名声再次远播。当迈克看着队员们的尸体被送回来时，他非常难过。罗毅即将离开部队，鲍尔斯因为没有按照上级要求执行任务而被革职，但大家心里都没有遗憾。迈克决定离开海豹突击队队员，组建一个新团队。这个团队怎么会没有这些老搭档呢？大家都信心满满，期待新的生活，再次为正义而战！